RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pip4k2cQ91XU3 421 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn22Q9D7U6 220 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gdap2Q9DBL2 498 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab27aQ9ERI2 221 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef37A1IGU4 676 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm12394A2AKP6 982 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp8b4A2ANX3 1194 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcb5B5X0E4 1255 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20503G3UZK1 150 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptpn11P35235 597 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fastkd5Q7TMV3 762 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DcstampQ7TNJ0 470 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr670Q7TRP3 312 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Got1l1Q7TSV6 404 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nim1kQ8BHI9 436 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl2Q8JZP3 593 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nudcd3Q8R1N4 363 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gstm4Q8R5I6 218 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc22a19Q8VCA0 551 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr615Q8VGY4 313 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bbs5Q9CZQ9 341 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acp4D3YTS9 425 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kbtbd2G3X9X1 623 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DffaO54786 331 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Soat2O88908 525 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glb1P23780 647 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbxas1P36423 533 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc1a2P43006 572 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zscan2Q07230 614 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc127Q3TC33 260 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntrk1Q3UFB7 799 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ampd1Q3V1D3 745 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ksr1Q61097 873 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rasa4Q6PFQ7 802 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cand2Q6ZQ73 1235 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smtnl2Q8CI12 456 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim61Q8JZK6 461 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr449Q8VGW8 311 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efhc1Q9D9T8 648 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ParvbQ9ES46 365 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vwa7Q9JHA8 891 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3371F7CQW8 167 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gml2G5E8L7 176 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chil3O35744 398 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SftpdP50404 374 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc12a1P55014 1095 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kctd8Q50H33 476 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wscd1Q80XH4 572 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem260Q8BMD6 703 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp64Q99KE8 643 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Leng1Q9DB98 261 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rtl9Q32KG4 1339 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfrsf11bO08712 401 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nedd9O35177 833 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc1a6O35544 561 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sept7O55131 436 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il3P01586 166 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfm3P63056 478 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gata5P97489 404 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FaxcQ3UMF9 409 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acvrl1Q61288 502 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PoliQ6R3M4 717 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf784Q8BI69 297 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rftn2Q8CHX7 500 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trib2Q8K4K3 343 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spns2Q91VM4 549 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NelfcdQ922L6 591 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ier5lQ99J55 406 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thg1lQ9CY52 298 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim42Q9D2H5 723 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem86aQ9D8N3 241 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt7Q9DCV7 457 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dmap1Q9JI44 468 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpm5Q9JJH7 1158 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd16A2AS55 361 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spin2fJ3QPU0 254 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtgisO35074 501 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gja8P28236 440 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd86P42082 309 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SftpbP50405 377 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2c39P56656 490 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itm2aQ61500 263 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stx3Q64704 289 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ldlrap1Q8C142 308 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kat14Q8CID0 779 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SmtnQ921U8 923 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms