RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 RPL26P61254 145 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ZNF534Q76KX8 674 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 RMDN3Q96TC7 470 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 GMEB1Q9Y692 573 aa21.16■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ADCY6O43306 1168 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 DCXO43602 365 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB14O43829 449 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 FBXO21O94952 628 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 RBL1P28749 1068 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 EMP3P54852 163 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 MTTPP55157 894 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 CDH6P55285 790 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 TGFB2P61812 414 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PCLAFQ15004 111 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 SDCBP2Q9H190 292 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 GALK1P51570 392 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 XYLT1Q86Y38 959 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PXMP2Q9NR77 195 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.15■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 MAGEB3O15480 346 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PRKCGP05129 697 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 SLC5A2P31639 672 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 GRIA1P42261 906 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 GABRB2P47870 512 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 IYDQ6PHW0 289 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 GAB3Q8WWW8 586 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 NLRP4Q96MN2 994 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PIM2Q9P1W9 311 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 PAK5Q9P286 719 aa21.14■□□□□ 0.98
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 RAP1GAPP47736 663 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CNGA3Q16281 694 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.14■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 RSAD1Q9HA92 442 aa21.14■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CD19P15391 556 aa21.13■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.13■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 E2F8A0AVK6 867 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 COX4I1P13073 169 aa21.13■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CMTM5Q96DZ9 223 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.13■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 PLIN3O60664 434 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CCDC166P0CW27 439 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.12■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 TRNP1Q6NT89 227 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 KLC3Q6P597 504 aa21.12■□□□□ 0.97
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PMS1-222ENST00000639501 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 DMTF1Q9Y222 760 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 BTBD19C9JJ37 291 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 E9PBE3 544 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 KLHL41O60662 606 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 ASPAP45381 313 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.12■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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