RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SORT1	Q99523	831 aa		9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PICK1	Q9NRD5	415 aa		9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PNPO	Q9NVS9	261 aa		9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119		H0YCG3	227 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119		H7C0C1	242 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PIK3R2	O00459	728 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	VILL	O15195	856 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	BIRC5	O15392	142 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIN3B	O75182	1162 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOM1L1	O75674	476 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAD17	O75943	681 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PROC	P04070	461 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	HOXC6	P09630	235 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD19	P15391	556 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ITGAX	P20702	1163 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	OSBP	P22059	807 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATP5O	P48047	213 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDH6	P55285	790 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	FSTL1	Q12841	308 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CBX3	Q13185	183 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TBCC	Q15814	346 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	XKR3	Q5GH77	459 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	HPS6	Q86YV9	775 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	HIPK4	Q8NE63	616 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATG4C	Q96DT6	458 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RTP4	Q96DX8	246 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RNF146	Q9NTX7	359 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDH22	Q9UJ99	828 aa		9.08	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	AP1G1	O43747	822 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PGM3	O95394	542 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	METTL18	O95568	372 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	HMGCR	P04035	888 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	APRT	P07741	180 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ASNS	P08243	561 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAGEA6	P43360	314 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD151	P48509	253 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	IDH3A	P50213	366 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CNTN2	Q02246	1040 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDK3	Q15120	406 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TLR1	Q15399	786 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CA9	Q16790	459 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	JDP2	Q8WYK2	163 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAML3	Q96JK9	1138 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	LHX5	Q9H2C1	402 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RSAD1	Q9HA92	442 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	THAP1	Q9NVV9	213 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	POMP	Q9Y244	141 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	VWA5A	O00534	786 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MSC	O60682	206 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	9.07	□□□□□ -0.96	1e-8	■■■■□ 25.4
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDK4	P11802	303 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAG1	P15918	1043 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CYP3A5	P20815	502 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	XIAP	P98170	497 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	MPP3	Q13368	585 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	SNAPC2	Q13487	334 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	GK3P	Q14409	553 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCLAF	Q15004	111 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF699	Q32M78	642 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		9.07	□□□□□ -0.96

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