RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PLD4Q96BZ4 506 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CALML4Q96GE6 196 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 AK8Q96MA6 479 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 STRA6Q9BX79 667 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PTPRJQ12913 1337 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 AP5Z1O43299 807 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SH3BP5O60239 455 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GJB3O75712 270 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GHRHP01286 108 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ADH5P11766 374 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PFKLP17858 780 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ABCD1P33897 745 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GRIK1P39086 918 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 DPP6P42658 865 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CACNA2D1P54289 1103 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RBP5P82980 135 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ZNF33AQ06730 810 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 POSTNQ15063 836 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 VSTM1Q6UX27 236 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 DYMQ7RTS9 669 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PDZD3Q86UT5 571 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 MIB1Q86YT6 1006 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CEP76Q8TAP6 659 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 HVCN1Q96D96 273 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 KIF2CQ99661 725 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RBSNQ9H1K0 784 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CD93Q9NPY3 652 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CDH9Q9ULB4 789 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 NME7Q9Y5B8 376 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.32□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 F8VP50 259 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TRIM24O15164 1050 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ABL1P00519 1130 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PDGFRBP09619 1106 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 DDIT3P35638 169 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 WASP42768 502 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TNFRSF4P43489 277 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CASP5P51878 434 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CYP27A1Q02318 531 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TAF10Q12962 218 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 USP49Q70CQ1 688 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TREML1Q86YW5 311 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 NAT16Q8N8M0 369 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 WBP2Q969T9 261 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PCED1BQ96HM7 432 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 CD248Q9HCU0 757 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.31□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.3□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PQF6 199 aa9.3□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.3□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms