RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF10BO14763 440 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 LCP1P13796 627 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 WEE1P30291 646 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEA11P43364 429 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 C2CD6Q53TS8 623 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3RF2Q8TEC5 729 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PHOX2BQ99453 314 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP3A43Q9HB55 503 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 CPQQ9Y646 472 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQH9 124 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR33A8MZF0 331 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 CREB3O43889 395 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 STK10O94804 968 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 NOL4O94818 638 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PRLRP16471 622 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PON1P27169 355 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNMA1Q12791 1236 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 CETN1Q12798 172 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOC3L4Q17RC7 722 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 HGSNATQ68CP4 663 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf74Q6P047 294 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC93AQ86WB7 457 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 UBALD2Q8IYN6 164 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL6Q8N531 539 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 EDEM1Q92611 657 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 NOX5Q96PH1 765 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MIS12Q9H081 205 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM186AA6NE01 2351 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PAFAH1B1P43034 410 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ARID5AQ03989 594 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf87Q6PH81 154 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MON1AQ86VX9 555 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf48Q96LL4 319 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SLITRK1Q96PX8 696 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 NAGPAQ9UK23 515 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 HHLA1C9JL84 531 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 M0QYV0 167 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PJA2O43164 708 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 COCHO43405 550 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 GNA14O95837 355 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MESP2Q0VG99 397 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TSSK4Q6SA08 328 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 PMM1Q92871 262 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MAFFQ9ULX9 164 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ESYT3A0FGR9 886 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SHISA7A6NL88 538 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM170BA6NMN3 283 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ECI2O75521 394 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 AVPR2P30518 371 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ADIGQ0VDE8 80 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 SGO2Q562F6 1265 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 RTL10Q7L3V2 364 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 MYRFLQ96LU7 910 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP16Q9BY84 665 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP97Q9P2B7 532 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.08□□□□□ -0.31
RABGEF1-209ENST00000607882 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GABBR2O75899 941 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FTCDO95954 541 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 POU2F2P09086 479 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PMF1Q6P1K2 205 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GBP6Q6ZN66 633 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 LEMD2Q8NC56 503 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA17Q96L03 361 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SIX2Q9NPC8 291 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 O00370 1275 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM24O15164 1050 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR5O60602 858 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms