RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX24	Q9Y343	169 aa		15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	NFS1	Q9Y697	457 aa		15.99	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CST8	O60676	142 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ZBED1	O96006	694 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FGFR3	P22607	806 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	BLMH	Q13867	455 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PTK6	Q13882	451 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DCAF6	Q58WW2	860 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	HAUS1	Q96CS2	278 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	B3GALT6	Q96L58	329 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CALN1	Q9BXU9	219 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	USP3	Q9Y6I4	520 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TP73	O15350	636 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP2F1	P24903	491 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	IVD	P26440	423 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	HSD17B3	P37058	310 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SULT1E1	P49888	294 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	IKBKE	Q14164	716 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	QPCT	Q16769	361 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ACCSL	Q4AC99	568 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FUT10	Q6P4F1	479 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CROCCP2	Q86T23	111 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SCML4	Q8N228	414 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRC43	Q8N309	656 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC185	Q8N715	623 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	15.98	■□□□□ 0.15	1e-6	■■■■□ 20.4
DDX39A-209	ENST00000589318	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		15.98	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	15.97	■□□□□ 0.15	1e-6	■■■■■ 49.9
DDX39A-209	ENST00000589318	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TNFRSF10B	O14763	440 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DGKI	O75912	1065 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	UPP2	O95045	317 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	EFEMP2	O95967	443 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	LTF	P02788	710 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DES	P17661	470 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	RFC2	P35250	354 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DYNLT1	P63172	113 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF844	Q08AG5	666 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PDK2	Q15119	407 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DPYSL2	Q16555	572 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	VSIG1	Q86XK7	387 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		15.97	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D4	O60343	1298 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	L1CAM	P32004	1257 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTL9	Q8TC94	416 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	FAF2	Q96CS3	445 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF157	Q96PX1	679 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	CWH43	Q9H720	699 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PTPRS	Q13332	1948 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318	PLXNA3	P51805	1871 aa		15.96	■□□□□ 0.15
DDX39A-209	ENST00000589318		A6NHS1	94 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	APOC2	P02655	101 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	KLRC2	P26717	231 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RPS6KA3	P51812	740 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		15.96	■□□□□ 0.14

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