RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	RAD54B	Q9Y620	910 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	BIN1	O00499	593 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	NDUFV2	P19404	249 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	BMP6	P22004	513 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	MFAP3	P55082	362 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	IRX4	P78413	519 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	EDEM1	Q92611	657 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	P2RY11	Q96G91	374 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084		E7ENQ6	273 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	NPC1	O15118	1278 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	GNA14	O95837	355 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	LCP1	P13796	627 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	STARD3	Q14849	445 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	E2F5	Q15329	346 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	STIL	Q15468	1287 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CNGA2	Q16280	664 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	PKDCC	Q504Y2	493 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	SCML4	Q8N228	414 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	TFAP2B	Q92481	460 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CD248	Q9HCU0	757 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	WASH3P	C4AMC7	463 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	KCNK5	O95279	499 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	STX17	P56962	302 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	LMAN2	Q12907	356 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	GEN1	Q17RS7	908 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-225	ENST00000585084	RGS7	P49802	495 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	DAOA	P59103	153 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PAK1	Q13153	545 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	RRAGA	Q7L523	313 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	DEFB119	Q8N690	84 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	LMO3	Q8TAP4	145 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	KAT5	Q92993	513 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084		M0QYV0	167 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ITPKA	P23677	461 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	HOXD12	P35452	270 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	KCNH2	Q12809	1159 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	MPPE1	Q53F39	396 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	29.75	■■■□□ 2.35	2e-7	■■□□□ 12.7
GPS1-225	ENST00000585084	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF132	P52740	706 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF445	P59923	1031 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	GCNT1	Q02742	428 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF33A	Q06730	810 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PMF1	Q6P1K2	205 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	GOLGA1	Q92805	767 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3R2	O00459	728 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	TSPAN3	O60637	253 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	NDUFS2	O75306	463 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ARID5A	Q03989	594 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	CEP76	Q8TAP6	659 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	HSFY1	Q96LI6	401 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	CIPC	Q9C0C6	399 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-225	ENST00000585084	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		29.73	■■■□□ 2.35

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