RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 HMBSP08397 361 aa21.88■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 CNGA2Q16280 664 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC42-203ENST00000581598 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC42-203ENST00000581598 TMEM270Q6UE05 265 aa21.88■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.88■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC42-203ENST00000581598 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC42-203ENST00000581598 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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CCDC42-203ENST00000581598 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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