RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	WDR24	Q96S15	920 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TNR	Q92752	1358 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	BCAR3	O75815	825 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CDK4	P11802	303 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	GABRB3	P28472	473 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	STT3A	P46977	705 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MTHFS	P49914	203 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FCHO1	O14526	889 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CA12	O43570	354 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	NCK2	O43639	380 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	WDR47	O94967	919 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CD19	P15391	556 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ADRA1D	P25100	572 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MST1	P26927	711 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ZNF81	P51508	661 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KIF14	Q15058	1648 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CLIC1	O00299	241 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	APOL1	O14791	398 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DHH	O43323	396 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SNX2	O60749	519 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GCAT	O75600	419 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	USP1	O94782	785 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MYL3	P08590	195 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC5A2	P31639	672 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PBX1	P40424	430 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PICALM	Q13492	652 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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