RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.45■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 EPHB6O15197 1021 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 TYRP14679 529 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 NOMO3P69849 1222 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 VPS36Q86VN1 386 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS33Q8NF86 280 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM122AQ96E09 287 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0A0MRY4 1105 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 GABBR2O75899 941 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 KAT7O95251 611 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 IGLV3-27P01718 113 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 OPRD1P41143 372 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 MATKP42679 507 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 FMO1Q01740 532 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 CENPCQ03188 943 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 MPP7Q5T2T1 576 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM25Q86YD3 366 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 DDI1Q8WTU0 396 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 RNF34Q969K3 372 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 CHFRQ96EP1 664 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 AGPAT1Q99943 283 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.42■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 NPC1O15118 1278 aa16.42■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 TULP3O75386 442 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 EGFP01133 1207 aa16.42■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 TCF15Q12870 199 aa16.42■□□□□ 0.22
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RABGGTA-205ENST00000558534 DEFB106AQ8N104 65 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 TERB1Q8NA31 727 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC53A6NM62 1247 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 H0Y858 1186 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RABGGTA-205ENST00000558534 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
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