RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAST3	O60307	1309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		A0A1B0GVC2	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LINC00473	A8K010	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		A8MVJ9	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUV39H1	O43463	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ONECUT2	O95948	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADH4	P08319	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADRA1B	P35368	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ACVRL1	P37023	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DIO1	P49895	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCR5	P51681	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TPTE	P56180	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		Q6ZPA2	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		H0YIZ8	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NXPH3	O95157	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LARGE1	O95461	756 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HKR1	P10072	659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NDUFB7	P17568	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADRA1D	P25100	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CXCR5	P32302	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DGKQ	P52824	942 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TAP1	Q03518	808 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LMAN2	Q12907	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP51	Q70EK9	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DERA	Q9Y315	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		J3KRW8	73 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	QSOX1	O00391	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KAT7	O95251	611 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ESRRB	O95718	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TTLL1	O95922	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms