RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	INSRR	P14616	1297 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CSF2RA	P15509	400 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNA2	P16389	499 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	AKAP5	P24588	427 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MCM7	P33993	719 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	THPO	P40225	353 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNQ1	P51787	676 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MALL	Q13021	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	BFSP2	Q13515	415 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SHH	Q15465	462 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HSCB	Q8IWL3	235 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MIER2	Q8N344	545 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	METTL13	Q8N6R0	699 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KAT2B	Q92831	832 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FATE1	Q969F0	183 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	LMF1	Q96S06	567 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF302	Q9NR11	478 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HTT	P42858	3142 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SI	P14410	1827 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A087WWV3	80 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KIAA0355	O15063	1070 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NRP2	O60462	931 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CD4	P01730	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	POU2F2	P09086	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ITGB8	P26012	769 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GNAL	P38405	381 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RRAD	P55042	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CD69	Q07108	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MGAT5	Q09328	741 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ST3GAL1	Q11201	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PPFIA1	Q13136	1202 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CALCRL	Q16602	461 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF365	Q70YC5	407 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	WDR92	Q96MX6	357 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KLC2	Q9H0B6	622 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GINS2	Q9Y248	185 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NFASC	O94856	1347 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570		M0QZ92	97 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	AP1G1	O43747	822 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC37A4	O43826	429 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF623	O75123	536 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM127	O75204	238 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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