RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CD248	Q9HCU0	757 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SPTBN2	O15020	2390 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	BECN2	A8MW95	431 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LTF	P02788	710 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	FYN	P06241	537 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	KRT5	P13647	590 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LCP1	P13796	627 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	RGS7	P49802	495 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	E2F5	Q15329	346 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	EDEM1	Q92611	657 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQF6	199 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CALCA	P01258	141 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CYBB	P04839	570 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	HMBS	P08397	361 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	C7	P10643	843 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	P2RY2	P41231	377 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ELF2	Q15723	593 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DCLK1	O15075	740 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	IRAK2	O43187	625 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TIMM44	O43615	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	HOXB2	P14652	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GNA15	P30679	374 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LIMK1	P53667	647 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ACOX2	Q99424	681 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SLC30A4	O14863	429 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	THAP12	O43422	761 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GLI1	P08151	1106 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GABRG2	P18507	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CLCN1	P35523	988 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MPL	P40238	635 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SLC11A2	P49281	568 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	BPIFB4	P59827	614 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	APBA1	Q02410	837 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PTK2	Q05397	1052 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	PDCL	Q13371	301 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.96	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms