RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-204ENST00000538708 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FANCEQ9HB96 536 aa9.72□□□□□ -0.85
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