RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 TCTN1Q2MV58 587 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 EMC10Q5UCC4 262 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 KAZNQ674X7 775 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PALM2Q8IXS6 379 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 Q8N1X5 172 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 Q8TCH9 128 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SKA1Q96BD8 255 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PANK2Q9BZ23 570 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 FAM107BQ9H098 131 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RGL1Q9NZL6 768 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 NBNO60934 754 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF623O75123 536 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SLC1A4P43007 532 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PEX5P50542 639 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SNAP25P60880 206 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ITIH3Q06033 890 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 RBL2Q08999 1139 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TUBA3CQ13748 450 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GPR19Q15760 415 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTGISQ16647 500 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SESTD1Q86VW0 696 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 STK39Q9UEW8 545 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 EFCAB14O75071 495 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ARIH2O95376 493 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ICAM1P05362 532 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IVLP07476 585 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TSPY3P0CV98 308 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TSPY8P0CW00 308 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SFTPCP11686 197 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 AP2B1P63010 937 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LAMB3Q13751 1172 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 INAQ16352 499 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FIGNQ5HY92 759 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 GBP6Q6ZN66 633 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 LRRC43Q8N309 656 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 IQUBQ8NA54 791 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SCFD2Q8WU76 684 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 NELL1Q92832 810 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PTPRN2Q92932 1015 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 CHST12Q9NRB3 414 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FAM50BQ9Y247 325 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 FAM186AA6NE01 2351 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 MAN2B1O00754 1011 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 AMY2AP04746 511 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-212ENST00000535535 PYGLP06737 847 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms