RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 SNAP23O00161 211 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS3O15072 1205 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SERPINB2P05120 415 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-DOAP06340 250 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPY3P0CV98 308 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPY8P0CW00 308 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CKMT1AP12532 417 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ALAS1P13196 640 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TUBP50607 506 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MXRA7P84157 204 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPY1Q01534 308 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHRNDQ07001 517 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DPTQ07507 201 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 STARD3Q14849 445 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POSTNQ15063 836 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LPIN2Q92539 896 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PRRX2Q99811 253 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MED23Q9ULK4 1368 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FSD2A1L4K1 749 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FFAR2O15552 330 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LPXNO60711 386 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TAF5LO75529 589 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 REC8O95072 547 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TBX18O95935 607 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM200BP0CF97 657 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RPS6KB1P23443 525 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 INHBCP55103 352 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PRKG1Q13976 671 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KIF22Q14807 665 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC15A2Q16348 729 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 METRNLQ641Q3 311 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CASC1Q6TDU7 716 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CNBD1Q8NA66 436 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 COA7Q96BR5 231 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMX3Q96JJ7 454 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CDHR1Q96JP9 859 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM227BQ96M60 508 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RMDN3Q96TC7 470 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CGRRF1Q99675 332 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 RAD50Q92878 1312 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POM121BA6NF01 834 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC154A6NI56 674 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 A6NLC8 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HIP1O00291 1037 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FGF18O76093 207 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MYF5P13349 255 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HSPA4P34932 840 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PHKA1P46020 1223 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ARL4CP56559 192 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CDC42EP1Q00587 391 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF543Q08ER8 600 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
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