RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PROM1O43490 865 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH18Q13634 790 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPA6Q8N4T0 437 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POF1BQ8WVV4 589 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSFY1Q96LI6 401 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM38O00635 465 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTN2O75298 545 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPAG7O75391 227 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1RP00736 705 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 S100A5P33763 92 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNASQ5JWF2 1037 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RASEFQ8IZ41 740 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSKH2Q96QS6 385 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VPS18Q9P253 973 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP18Q9UMW8 372 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESRRBO95718 433 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHRNA5P30532 468 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANGPT1Q15389 498 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BICRALQ6AI39 1079 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOCADQ5VW36 1801 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFRSF10BO14763 440 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CALB2P22676 271 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ENKURQ8TC29 256 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 APOL4Q9BPW4 351 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NINQ8N4C6 2090 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF398Q8TD17 642 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TP53INP1Q96A56 240 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLITRK2Q9H156 845 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRKAB2O43741 272 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDCLQ13371 301 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIF1AQ16665 826 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TXNDC8Q6A555 127 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTFR2Q6P444 385 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABHD8Q96I13 439 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ISCA1Q9BUE6 129 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ISPDA4D126 451 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRIT1O00522 736 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM16LQ309B1 348 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HEATR9A2RTY3 570 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LUZP2Q86TE4 346 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAPGEF5Q92565 580 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF181Q9P0P0 153 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNTNAP1P78357 1384 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LPLP06858 475 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms