RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284		M0QZQ0	153 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM38	O00635	465 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	FCHO1	O14526	889 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	FYB1	O15117	783 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	TCEA3	O75764	348 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	CER1	O95813	267 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	ALAD	P13716	330 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	AKT1	P31749	480 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	JAK3	P52333	1124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	POLE2	P56282	527 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBA4A	P68366	448 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNB1	Q14721	858 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	ASB2	Q96Q27	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRK-215	ENST00000498284	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	PPFIA2	O75334	1257 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKCG	P05129	697 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	DUSP1	P28562	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXO1	Q12778	655 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ERAP2	Q6P179	960 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEH1	Q9H213	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ACTL6B	O94805	426 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	GYS1	P13807	737 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	MATN1	P21941	496 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CBFB	Q13951	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	MYCT1	Q8N699	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	DPF1	Q92782	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	NBN	O60934	754 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP2D6	P10635	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC14A1	Q13336	389 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CNGA3	Q16281	694 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM60	Q495X7	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ANO1	Q5XXA6	986 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	GLMP	Q8WWB7	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	FAR2	Q96K12	515 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRK-215	ENST00000498284	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms