RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 RNF8O76064 485 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CLUHO75153 1309 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 PDGFRAP16234 1089 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 PTPN5P54829 565 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 LRRC38Q5VT99 294 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CXorf38Q8TB03 319 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CASP10Q92851 521 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 WNT8BQ93098 351 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MIS12Q9H081 205 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ASB7Q9H672 318 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PAEPP09466 180 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PDGFRBP09619 1106 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KDELR1P24390 212 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CLCN5P51795 746 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 MPP2Q14168 576 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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HERC4-211ENST00000492996 CLEC1BQ9P126 229 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DPP7Q9UHL4 492 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 USP18Q9UMW8 372 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CITO14578 2027 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SPAG7O75391 227 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KRT7P08729 469 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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