RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	BECN2	A8MW95	431 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404		E5RJQ4	531 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SGK1	O00141	431 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TRIM24	O15164	1050 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	LATS1	O95835	1130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	HOXB2	P14652	356 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	GPD2	P43304	727 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF445	P59923	1031 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	LMNB2	Q03252	620 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ELF2	Q15723	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PGBD3	Q8N328	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT9	P35527	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC11A2	P49281	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TBX4	P57082	545 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SNX16	P57768	344 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	BPIFB4	P59827	614 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TSPAN3	O60637	253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	LRP3	O75074	770 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ADAM23	O75077	832 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	GABBR2	O75899	941 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	APOE	P02649	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	NTSR1	P30989	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	WAS	P42768	502 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ID4	P47928	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MYL5	Q02045	173 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ARID5A	Q03989	594 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	STARD3	Q14849	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	E2F5	Q15329	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	EPN2	O95208	641 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	RING1	Q06587	406 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	NNT	Q13423	1086 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT31	Q15323	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CHMP3-208	ENST00000486404	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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