RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ATP2A3Q93084 1043 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MECRQ9BV79 373 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CAPN15O75808 1086 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF286BP0CG31 522 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 STX3Q13277 289 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 RCN1Q15293 331 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TEX44Q53QW1 395 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 DLK2Q6UY11 383 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF534Q76KX8 674 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SCN1AP35498 2009 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0A0MRY4 1105 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 UGT1A9O60656 530 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MAGEC1O60732 1142 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CIB2O75838 187 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 WASHC5Q12768 1159 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 STEAP4Q687X5 459 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CASC4Q6P4E1 433 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 STRADAQ7RTN6 431 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 C7orf31Q8N865 590 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SNX27Q96L92 541 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SPATA13Q96N96 652 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 THAP1Q9NVV9 213 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 B2RBV5 119 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 H3BRB1 525 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PSMG1O95456 288 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 AQP5P55064 265 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CCNA1P78396 465 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CDC42EP1Q00587 391 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SLC34A1Q06495 639 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 GRIK4Q16099 956 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TTC7BQ86TV6 843 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 RILPQ96NA2 401 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 NAT9Q9BTE0 207 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SNTG2Q9NY99 539 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ARMCX1Q9P291 453 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 CAPN14A8MX76 684 aa15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 GLRA3O75311 464 aa15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ALDH1A2O94788 518 aa15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 LCP1P13796 627 aa15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 RAP1GDS1P52306 607 aa15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
C9orf3-218ENST00000482056 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms