RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 LHX6Q9UPM6 363 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZNF217O75362 1048 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DKK1O94907 266 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NCAM1P13591 858 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CD6P30203 668 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PIK3CAP42336 1068 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ME1P48163 572 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 VAMP7P51809 220 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RAD23BP54727 409 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CKAP5Q14008 2032 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RAB41Q5JT25 222 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 LAYNQ6UX15 382 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PIGZQ86VD9 579 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NAXDQ8IW45 347 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ZNF366Q8N895 744 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TAF4BQ92750 862 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MTG2Q9H4K7 406 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MYH10P35580 1976 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 BPTFQ12830 3046 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 METTL12A8MUP2 240 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 KCNK3O14649 394 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 IKBKBO14920 756 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 IGLV3-19P01714 112 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 C7P10643 843 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PTPRNQ16849 979 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DENND1CQ8IV53 801 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MDM1Q8TC05 714 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SNX21Q969T3 373 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 LMLNQ96KR4 655 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ELOVL2Q9NXB9 296 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTS20P59510 1910 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GVT2 93 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 C10orf142B7Z368 130 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CLSTN1O94985 981 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CALCAP01258 141 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SYPP08247 313 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 HLA-FP30511 346 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ACSL1P33121 698 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DPP6P42658 865 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NDUFA8P51970 172 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DPYDQ12882 1025 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NFIL3Q16649 462 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 UBR7Q8N806 425 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CRELD1Q96HD1 420 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 EXOC1Q9NV70 894 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PTPRBP23467 1997 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GTW7 788 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SLC12A8A0AV02 714 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MAPK13O15264 365 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms