RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 IFNB1P01574 187 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 HSD17B3P37058 310 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MON1AQ86VX9 555 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SPATA17Q96L03 361 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 YME1L1Q96TA2 773 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 WDCPQ9H6R7 721 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 NMUR1Q9HB89 426 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 IL37Q9NZH6 218 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 WDR27A2RRH5 827 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 H7C0C1 242 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SOAT2O75908 522 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ETS1P14921 441 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ATP5OP48047 213 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GDF10P55107 478 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 USP46P62068 366 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM193AP78312 1265 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GPS1Q13098 491 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RUFY1Q96T51 708 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MED4Q9NPJ6 270 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 NDC80O14777 642 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ADAM12O43184 909 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 IRAK2O43187 625 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CREB3O43889 395 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 AMPD1P23109 780 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 YWHAQP27348 245 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 OR1D2P34982 312 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 NR2C2P49116 596 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PGFP49763 221 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DUSP4Q13115 394 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GPR152Q8TDT2 470 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RNF34Q969K3 372 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SPG21Q9NZD8 308 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM92AA1XBS5 289 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 C2CD2LO14523 706 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GGCXP38435 758 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GLUD2P49448 558 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 19.6
CTU2-202ENST00000453996 SLMAPQ14BN4 828 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 IQCKQ8N0W5 287 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZBTB9Q96C00 473 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZIM3Q96PE6 472 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 COMMD8Q9NX08 183 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GMIPQ9P107 970 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CFAP69A5D8W1 941 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZBBXA8MT70 800 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 H3BQF6 201 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 I6L893 689 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 AGPSO00116 658 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DSG1Q02413 1049 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 GBE1Q04446 702 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SEMA3BQ13214 749 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RFX8Q6ZV50 586 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FBXO32Q969P5 355 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PMS2P54278 862 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 XRCC4Q13426 336 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 DPYSQ14117 519 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CASP10Q92851 521 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.1■■□□□ 1.13
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