RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ECT2Q9H8V3 914 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 VCANP13611 3396 aa9.3□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PTPRDP23468 1912 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 A0A0A0MRY4 1105 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 A0A1W2PQH9 124 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ANKRD62A6NC57 917 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TIMM44O43615 452 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CALB1P05937 261 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP1A3P13637 1013 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 AVPR2P30518 371 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PRKCIP41743 596 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NRLP54845 237 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB15P59190 212 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ZBED6P86452 979 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CDK17Q00537 523 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC6A3Q01959 620 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SCD5Q86SK9 330 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 LUZP1Q86V48 1076 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PJA1Q8NG27 643 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF592Q92610 1267 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 DONSONQ9NYP3 566 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 MARK1Q9P0L2 795 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NOTCH4Q99466 2003 aa9.29□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM170BA6NMN3 283 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 DKK1O94907 266 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PRAMEF12O95522 483 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 APOEP02649 317 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ERBB2P04626 1255 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 MYBL1P10243 752 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NCAM1P13591 858 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 LCP1P13796 627 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NOS2P35228 1153 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TNFRSF4P43489 277 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 AIF1P55008 147 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 GRM2Q14416 872 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC142Q17RM4 750 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ADGRF1Q5T601 910 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 GJB7Q6PEY0 223 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SARM1Q6SZW1 724 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.28□□□□□ -0.92
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 KRBA1A5PL33 1030 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 E5RJQ4 531 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 E7ENQ6 273 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 ADH5P11766 374 aa9.27□□□□□ -0.93
PAICSP3-201ENST00000428007 ABCB4P21439 1286 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms