RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 KRT17Q04695 432 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 KRT71Q3SY84 523 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 VSTM1Q6UX27 236 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GPD1P21695 349 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MAN1A1P33908 653 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MAGEA11P43364 429 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PEX5P50542 639 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CROCCP2Q86T23 111 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 NIPA2Q8N8Q9 360 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CNGB3Q9NQW8 809 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MYO7AQ13402 2215 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 LILRB3O75022 631 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZBED1O96006 694 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SLC1A1P43005 524 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 RWDD2BP57060 319 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CCDC14Q49A88 953 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 RNF217Q8TC41 542 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 USP3Q9Y6I4 520 aa25.37■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SCNN1AP37088 669 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 C8orf48Q96LL4 319 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PPFIA2O75334 1257 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 LRCH4O75427 683 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 FYNP06241 537 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CA3P07451 260 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 DNAJB1P25685 340 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ATP11AP98196 1134 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CDO1Q16878 200 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 AADACL2Q6P093 401 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PGM2Q96G03 612 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 FBXO21O94952 628 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SEC24AO95486 1093 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CTSAP10619 480 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CTNNA2P26232 953 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GJC1P36383 396 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PGFP49763 221 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 USP46P62068 366 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 DEFB106AQ8N104 65 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TEX28O15482 410 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ABLIM3O94929 683 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CA8P35219 290 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PBX2P40425 430 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MMP13P45452 471 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ERVFC1P60507 584 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTU1-201ENST00000421832 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTU1-201ENST00000421832 AGAP11Q8TF27 550 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CNPY3Q9BT09 278 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.35■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 NUDT17P0C025 328 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZNF570Q96NI8 536 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 GDF15Q99988 308 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 DPYSL4O14531 572 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ATF6P18850 670 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 IL1R2P27930 398 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SDC4P31431 198 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ARCQ7LC44 396 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TEX9Q8N6V9 391 aa25.33■■□□□ 1.65
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