RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MNTQ99583 582 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AGPAT1Q99943 283 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RUBCNLQ9H714 662 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NOD2Q9HC29 1040 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 F8VZ95 297 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DFFAO00273 331 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF197O14709 1029 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS5O15539 181 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PJA2O43164 708 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TREHO43280 583 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TSC22D2O75157 780 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFRSF21O75509 655 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO21O94952 628 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFA10O95299 355 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ASMTLO95671 621 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GLUD1P00367 558 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 F9P00740 461 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PAX7P23759 505 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3R1P27986 724 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MTTPP55157 894 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C21orf59P57076 290 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CUL2Q13617 745 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF7Q14155 803 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA21Q7Z572 469 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 COG1Q8WTW3 980 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP85Q9BW27 656 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM105AQ9NUU6 356 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PADI3Q9ULW8 664 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLAAQ9Y263 795 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ITM2BQ9Y287 266 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQC6 194 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC12A8A0AV02 714 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 F5H5T6 163 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL10O95999 233 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ACADMP11310 421 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP3A7P24462 503 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ICAM3P32942 547 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP2C18P33260 490 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TALDO1P37837 337 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB15P59190 212 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PRAMEP78395 509 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIK3Q13003 919 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GRB14Q14449 540 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF677Q86XU0 584 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SENP8Q96LD8 212 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CIPCQ9C0C6 399 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms