RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NT5MQ9NPB1 228 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 AP3B1O00203 1094 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 BAG2O95816 211 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 AMHP03971 560 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CD48P09326 243 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TPH1P17752 444 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NR2C2P49116 596 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ARFIP2P53365 341 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP61Q8NHU2 1237 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ART4Q93070 314 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RNF157Q96PX1 679 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ENDOD1O94919 500 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RAG1P15918 1043 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TWF1Q12792 350 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 LMO3Q8TAP4 145 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 HCRTO43612 131 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DIAPH2O60879 1101 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PLD1Q13393 1074 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 IKBKEQ14164 716 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FAM187BQ17R55 369 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CES3Q6UWW8 571 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ASIC4Q96FT7 647 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 HACD3Q9P035 362 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.34□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CLGNO14967 610 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 DAB1O75553 588 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ANXA9O76027 345 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 MGAT1P26572 445 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 CDH18Q13634 790 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00523Q86TU6 105 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ZWINTO95229 277 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 EPHB3P54753 998 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 GEMP55040 296 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 BMPR2Q13873 1038 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 TASP1Q9H6P5 420 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 PPCSQ9HAB8 311 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 CASP2P42575 452 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 TTC27Q6P3X3 843 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 TWNKQ96RR1 684 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SLC39A10Q9ULF5 831 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 NR2E1Q9Y466 385 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SNX2O60749 519 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 CYP3A5P20815 502 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 LILRA4P59901 499 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 GANCQ8TET4 914 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SERPINB11Q96P15 392 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 FAM8A1Q9UBU6 413 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 STYXL1Q9Y6J8 313 aa10.33□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ADCY6O43306 1168 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 ITGAVP06756 1048 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFV1P49821 464 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 WNT7BP56706 349 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 RRN3Q9NYV6 651 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.32□□□□□ -0.76
TTPAL-202ENST00000372904 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms