RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364007.1

RNU6-560P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 560, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-560P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-560P-201ENST00000364007 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TAF5Q15542 800 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 AWAT1Q58HT5 328 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 DENND2CQ68D51 928 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 ACSM6Q6P461 480 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 RRAGAQ7L523 313 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 SARAFQ96BY9 339 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 RTKNQ9BST9 563 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 VPS16Q9H269 839 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 FZD4Q9ULV1 537 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 DAPP1Q9UN19 280 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 AOX1Q06278 1338 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 CLIC1O00299 241 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 C1RP00736 705 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 CYP2D6P10635 497 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 AP2B1P63010 937 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 GAB1Q13480 694 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRKG1Q13976 671 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 FAM187BQ17R55 369 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRABD2AQ86V40 505 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 CHSY1Q86X52 802 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 SPATA5Q8NB90 893 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 NPIPB3Q92617 1050 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 RAB21Q9UL25 225 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-560P-201ENST00000364007 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 H3BNC9 293 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 MMP8P22894 467 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 THBS4P35443 961 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRKAA2P54646 552 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 POLE2P56282 527 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 TFF2Q03403 129 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 PROSER3Q2NL68 480 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRIM60Q495X7 471 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 HMGB4Q8WW32 186 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 RSC1A1Q92681 617 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 RILPL2Q969X0 211 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 CCDC17Q96LX7 622 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 HMX3A6NHT5 357 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 H7C1Q1 480 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 GCATO75600 419 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 KAT7O95251 611 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 JAK3P52333 1124 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 PROK1P58294 105 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 AAK1Q2M2I8 961 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM65Q6PI78 240 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 RUBCNQ92622 972 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 C3orf49Q96BT1 292 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 RITA1Q96K30 269 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-560P-201ENST00000364007 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms