RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 LRFN3Q9BTN0 628 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 C11orf16Q9NQ32 467 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 LRRD1A4D1F6 860 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 DCXO43602 365 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GLUD1P00367 558 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FYNP06241 537 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RARAP10276 462 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ATF6P18850 670 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 KDELR1P24390 212 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GPR15P49685 360 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TAF10Q12962 218 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 NNTQ13423 1086 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 KRT81Q14533 505 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SUSD6Q92537 303 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MS4A14Q96JA4 679 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 S1PR5Q9H228 398 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 DDIT4Q9NX09 232 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PQH9 124 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TGM5O43548 720 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GPR37L1O60883 481 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TADA3O75528 432 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SEC24AO95486 1093 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 LRG1P02750 347 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TFDP2Q14188 446 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 EFHC2Q5JST6 749 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SCD5Q86SK9 330 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TTC13Q8NBP0 860 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GIPC2Q8TF65 315 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 EDEM1Q92611 657 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 WDCPQ9H6R7 721 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 FGF19O95750 216 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 IL1R2P27930 398 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 NME3Q13232 169 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RNF135Q8IUD6 432 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 HSPH1Q92598 858 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RNF34Q969K3 372 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PSMG2Q969U7 264 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF670Q9BS34 389 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 GMIPQ9P107 970 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MUTYHQ9UIF7 546 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TRIOO75962 3097 aa18.72■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SOAT2O75908 522 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 IGLV3-25P01717 112 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 MCM3P25205 808 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CCR1P32246 355 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 ARL4AP40617 200 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CXCR3P49682 368 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TUBP50607 506 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CLCN4P51793 760 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CDH6P55285 790 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 USP46P62068 366 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 SCAPQ12770 1279 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 TWF1Q12792 350 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 PPP2R5DQ14738 602 aa18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SYNE4-201ENST00000324444 DPYSL2Q16555 572 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms