RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP7D3Q8IWC1 876 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC185Q8N715 623 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 COG1Q8WTW3 980 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP4E1Q9UPM8 1137 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADRA1BP35368 520 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNDC8Q6A555 127 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTAN1Q96AB6 310 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPZA3Q96KX2 299 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TKTL2Q9H0I9 626 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FZD10Q9ULW2 581 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF185O15231 689 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOEP02649 317 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYGMP11217 842 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDCP19113 662 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAFAH1B1P43034 410 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 COG7P83436 770 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R5DQ14738 602 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF12L1Q5VU92 463 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF14Q9UBS8 474 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMBSP08397 361 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PFKLP17858 780 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDH6P55285 790 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDK2Q15119 407 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAB21L3Q8N8X9 362 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO9BQ13459 2157 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01565O15544 149 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GJA1P17302 382 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDELR1P24390 212 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 COPS2P61201 443 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLUL1Q15846 466 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAPGEF5Q92565 580 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM161BQ96MY7 647 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALN1Q9BXU9 219 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRFAP1Q9Y605 127 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRANK1O15050 2925 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLP2RO95838 553 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CKMP06732 381 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTHL1P78549 312 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RING1Q06587 406 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAPQ12770 1279 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTA1Q13330 715 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM15Q13444 863 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR158Q5T848 1215 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 EP400NLQ6ZTU2 488 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A13Q96H72 371 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRCH3Q96II8 777 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF38Q9H0F5 515 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAPLNO95428 1278 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR2P41597 374 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCEAL4Q96EI5 215 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A14Q96JA4 679 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMYM5Q9UJ78 669 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 HARS2P49590 506 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEAD2Q15562 447 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPYSL2Q16555 572 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLD4Q96BZ4 506 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAPLN3Q96S86 360 aa28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2S1Q96SQ9 504 aa28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms