RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 NR5A2O00482 541 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ME2P23368 584 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PTPN7P35236 360 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 INPP5AQ14642 412 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PDK1Q15118 436 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PGM5Q15124 567 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RNF139Q8WU17 664 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RCN3Q96D15 328 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 GGA3Q9NZ52 723 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PAMP19021 973 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 AP3M2P53677 418 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CDC16Q13042 620 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 BSNDQ8WZ55 320 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MKL1Q969V6 931 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TRIM13O60858 407 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 GRK2P25098 689 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CAP2P40123 477 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 NDST1P52848 882 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 VPS33BQ9H267 617 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 HACD3Q9P035 362 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.14■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 FESP07332 822 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RGS2P41220 211 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ZACNQ401N2 412 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 LGMNQ99538 433 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 APBA2Q99767 749 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SPON2Q9BUD6 331 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SMAPO00193 183 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 WFS1O76024 890 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TUBP50607 506 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 C12orf29Q8N999 325 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 DDI1Q8WTU0 396 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 EPAS1Q99814 870 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SPTLC1O15269 473 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 INPP4BO15327 924 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SPDYE6P0CI01 402 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 COX4I1P13073 169 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ABL2P42684 1182 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 SGO1Q5FBB7 561 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 DAW1Q8N136 415 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 BEST2Q8NFU1 509 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PPME1Q9Y570 386 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.13■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 A0A1B0GVG6 124 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 M0R3G1 203 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TM7SF2O76062 418 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TMEM63AO94886 807 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 NCAM1P13591 858 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TRAF2Q12933 501 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 TBCELQ5QJ74 424 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 BNIPLQ7Z465 357 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MBOAT7Q96N66 472 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 WDR41Q9HAD4 459 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PXMP2Q9NR77 195 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 GAKO14976 1311 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ZNF839A8K0R7 811 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 BAIAP3O94812 1187 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MGAT5Q09328 741 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ACVR2BQ13705 512 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 MAPRE2Q15555 327 aa16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
USP43-201ENST00000285199 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms