RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 USP6NLQ92738 828 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC39Q96DD0 335 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K7O14733 419 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FASP25445 335 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CRABP2P29373 138 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MARC1Q5VT66 337 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE1Q99829 537 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINI2O75830 405 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1B2P21281 511 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CCR1P32246 355 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 HACD1B0YJ81 288 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF8P28908 595 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 EFEMP1Q12805 493 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 APOC2P02655 101 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 HUNKP57058 714 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TBCELQ5QJ74 424 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A8A0AV02 714 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RHOCP08134 193 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A3P55017 1021 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KAT2BQ92831 832 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 AAASQ9NRG9 546 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3C2BO00750 1634 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA2D1P54289 1103 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KCNMB4Q86W47 210 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LZTR1Q8N653 840 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 H3BRB1 525 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RGL2O15211 777 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MTA1Q13330 715 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SYT15Q9BQS2 421 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NDEL1Q9GZM8 345 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 IQGAP1P46940 1657 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP1Q6P2D0 407 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC103Q8IW40 242 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CENPTQ96BT3 561 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP42Q96MM3 310 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL6Q9H5J4 265 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD8Q9NX08 183 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CROTQ9UKG9 612 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DIP2BQ9P265 1576 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ACKR2O00590 384 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 BAIAP3O94812 1187 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINF2P08697 491 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RENBPP51606 427 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SOX10P56693 466 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RHOAP61586 193 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SDE2Q6IQ49 451 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR9Q96QG7 549 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT4DA6NG13 374 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RGS5O15539 181 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 OAZ1P54368 228 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LPK6 155 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CYP3A4P08684 503 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CDC16Q13042 620 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NR6A1Q15406 480 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF284Q2VY69 593 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 GLMNQ92990 594 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SYBUQ9NX95 663 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 UBP1Q9NZI7 540 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MEGF6O75095 1541 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DSG3P32926 999 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 POU6F1Q14863 301 aa21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms