RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 EHD3Q9NZN3 535 aa2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PGAP2Q9UHJ9 254 aa2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 DERAQ9Y315 318 aa2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 COL4A3Q01955 1670 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC38A8A6NNN8 435 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PROM1O43490 865 aa2.53□□□□□ -2
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SPTAN1-232ENST00000636483 PRAMEF2O60811 474 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 KAT7O95251 611 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TK1P04183 234 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM163BP0C2L3 166 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF20P17024 532 aa2.53□□□□□ -2
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SPTAN1-232ENST00000636483 GJD2Q9UKL4 321 aa2.53□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
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SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D3EA0A087X179 549 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
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SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.52□□□□□ -2.01
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SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 LYL1P12980 280 aa2.52□□□□□ -2.01
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SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
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SPTAN1-232ENST00000636483 AGTR2P50052 363 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
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SPTAN1-232ENST00000636483 FOXL2P58012 376 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 MPP1Q00013 466 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 UBE3AQ05086 875 aa2.52□□□□□ -2.01
SPTAN1-232ENST00000636483 LMAN2Q12907 356 aa2.52□□□□□ -2.01
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