RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635392.1

SMARCA2-240, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 291 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-240ENST00000635392 CHODLQ9H9P2 273 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 GLOD4Q9HC38 313 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NFU1Q9UMS0 254 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 A8MVJ9 347 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 M0QYT0 321 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PRRG2O14669 202 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 LARGE1O95461 756 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CD4P01730 458 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 RXRAP19793 462 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 YY1P25490 414 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 ITPKBP27987 946 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SERPINA4P29622 427 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 LIFRP42702 1097 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 RXRGP48443 463 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NR1H2P55055 460 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 VAMP2P63027 116 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 UBE3AQ05086 875 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TBCCQ15814 346 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TREML2Q5T2D2 321 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SYT13Q7L8C5 426 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SYNE4Q8N205 404 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 RFKQ969G6 155 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 LENG9Q96B70 501 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 R3HDM4Q96D70 268 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 FZD1Q9UP38 647 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 A6NLC8 198 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PMPCBO75439 489 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KRT38O76015 456 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 FESP07332 822 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TMEM225BP0DP42 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 BDNFP23560 247 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PCSK6P29122 969 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CLCN2P51788 898 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 GUCY1B3Q02153 619 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DCTN1Q14203 1278 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 HMGB4Q8WW32 186 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CPT1BQ92523 772 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PGBD1Q96JS3 809 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 C8orf49Q96NF6 230 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DERAQ9Y315 318 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DISP1Q96F81 1524 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 UACAQ9BZF9 1416 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PEX11BO96011 259 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 ATP1A3P13637 1013 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DRD1P21728 446 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 GKP32189 559 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 MTHFSP49914 203 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DEUP1Q05D60 604 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 SLC12A1Q13621 1099 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PTPRRQ15256 657 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMARCA2-240ENST00000635392 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 CXorf38Q8TB03 319 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 NPIPB3Q92617 1050 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 PRR25Q96S07 402 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 REEP2Q9BRK0 252 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KLC4Q9NSK0 619 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCA2-240ENST00000635392 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.85□□□□□ -1.31
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