RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617062.4

CU633904.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene CU633904.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633904.1-201ENST00000617062 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 DCLK3Q9C098 648 aa9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CKAP5Q14008 2032 aa9.24□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 O00370 1275 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 GFRA2O00451 464 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ADAM23O75077 832 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 LATS1O95835 1130 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ZBED1O96006 694 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 VDRP11473 427 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TYRP14679 529 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CHKAP35790 457 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 P2RY2P41231 377 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 DPP6P42658 865 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF132P52740 706 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF445P59923 1031 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CETN1Q12798 172 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 E2F5Q15329 346 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 LPAL2Q16609 132 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF394Q53GI3 561 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 SGO2Q562F6 1265 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 C2orf27AQ580R0 203 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PIGZQ86VD9 579 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CPXM2Q8N436 756 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 WBP2Q969T9 261 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PLD4Q96BZ4 506 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 GABRG3Q99928 467 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CD248Q9HCU0 757 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 VPS45Q9NRW7 570 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 NAGPAQ9UK23 515 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.23□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 SGK1O00141 431 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CISD3P0C7P0 127 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HOXD12P35452 270 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 MPLP40238 635 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 SEC13P55735 322 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 UBE2HP62256 183 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PDE4CQ08493 712 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PAK1Q13153 545 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ENPP2Q13822 863 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CNGA2Q16280 664 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 RNF43Q68DV7 783 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ALLCQ8N6M5 410 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 TTC13Q8NBP0 860 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 NELFBQ8WX92 580 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 IRGQQ8WZA9 623 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HSFY1Q96LI6 401 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 NT5C1BQ96P26 610 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 BBS2Q9BXC9 721 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HESX1Q9UBX0 185 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HCN2Q9UL51 889 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.22□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CU633904.1-201ENST00000617062 A0A1W2PQF6 199 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 TM4SF5O14894 197 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 KLKB1P03952 638 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 IRF1P10914 325 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 NTSR1P30989 418 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 DGKGP49619 791 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 TKTL1P51854 596 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 KDSRQ06136 332 aa9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CU633904.1-201ENST00000617062 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms