RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 RASSF3Q86WH2 238 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 DENND1CQ8IV53 801 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 SCML4Q8N228 414 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 DCLK3Q9C098 648 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 HCN2Q9UL51 889 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.53□□□□□ -0.08
APOC1-208ENST00000592535 PRRT4C9JH25 899 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DCLK1O15075 740 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 APBA1Q02410 837 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RNF139Q8WU17 664 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PLD4Q96BZ4 506 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 INVSQ9Y283 1065 aa14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NUP205Q92621 2012 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CEP250Q9BV73 2442 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LRP3O75074 770 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 EPN2O95208 641 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CISD3P0C7P0 127 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CHKAP35790 457 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DGKGP49619 791 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LMNB2Q03252 620 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PLK5Q496M5 336 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FYB2Q5VWT5 728 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GBP6Q6ZN66 633 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LOXL4Q96JB6 756 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HSFY1Q96LI6 401 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 THAP9Q9H5L6 903 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ACP6Q9NPH0 428 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FRYLO94915 3013 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 BECN2A8MW95 431 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ALDH1A2O94788 518 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 WASP42768 502 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GPD2P43304 727 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MFAP3P55082 362 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CCDC6Q16204 474 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CSRP2Q16527 193 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CPXM2Q8N436 756 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 IRGQQ8WZA9 623 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ACOX2Q99424 681 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 MIS12Q9H081 205 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FBXO10Q9UK96 956 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 THAP12O43422 761 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 FBXO21O94952 628 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 LTFP02788 710 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HOXB2P14652 356 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 BCKDHBP21953 392 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 PON1P27169 355 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GNA15P30679 374 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 NTSR1P30989 418 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 GBP1P32455 592 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC1-208ENST00000592535 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 412 ms