RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	RFFL	Q8WZ73	363 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	R3HDM4	Q96D70	268 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TBX20	Q9UMR3	447 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	XDH	P47989	1333 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A087X0M5	115 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1B0GX30	115 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PEX12	O00623	359 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CA12	O43570	354 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM20B	O75063	409 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	LARGE1	O95461	756 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CCR9	P51686	369 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608		Q6ZSN1	163 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	MAVS	Q7Z434	540 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	LPIN2	Q92539	896 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608		A1L4Q6	167 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ITGB3	P05106	788 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FES	P07332	822 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	COMT	P21964	271 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PGM1	P36871	562 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	VAV2	P52735	878 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PLP2	Q04941	152 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	REST	Q13127	1097 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PRKG2	Q13237	762 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR68	Q15743	365 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	C7orf26	Q96N11	449 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	USP44	Q9H0E7	712 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	GLOD4	Q9HC38	313 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	INTS13	Q9NVM9	706 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	POLG2	Q9UHN1	485 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	UNC119B	A6NIH7	251 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608		K7ENM7	598 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	DOK2	O60496	412 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ACP5	P13686	325 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	RRM1	P23921	792 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	MCM5	P33992	734 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	LIPA	P38571	399 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	POLD2	P49005	469 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	NUCB1	Q02818	461 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	ERV3-1	Q14264	604 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	CLCA4	Q14CN2	919 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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