RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SHBGP04278 402 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ALDH2P05091 517 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 MTFR1Q15390 333 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CENPUQ71F23 418 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CCDC77Q9BR77 488 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.25■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.313e-10■■■■■ 267.4
USP36-218ENST00000590546 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ABHD2P08910 425 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 MAGEA4P43358 317 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NME3Q13232 169 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TOX2Q96NM4 488 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CASD1Q96PB1 797 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TMEM209Q96SK2 561 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 HACD1B0YJ81 288 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 F8W810 466 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RASGRF2O14827 1237 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TCEA3O75764 348 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CXCL10P02778 98 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ADRA1BP35368 520 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 VSTM1Q6UX27 236 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 USP29Q9HBJ7 922 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PIGVQ9NUD9 493 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.24■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PTPRDP23468 1912 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ACSL3O95573 720 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 IVLP07476 585 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CAPN2P17655 700 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 GRIK1P39086 918 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 KYNUQ16719 465 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RNF139Q8WU17 664 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CPT1BQ92523 772 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SERPINB12Q96P63 405 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 HIPK3Q9H422 1215 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.23■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 OR6C75A6NL08 312 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ALOX15BO15296 676 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 KCNN4O15554 427 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 AGTP01019 485 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 GOT1P17174 413 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 HCAR3P49019 387 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CDR1P51861 262 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ARL4CP56559 192 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 HIF1AQ16665 826 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 MFSD5Q6N075 450 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TLCD1Q96CP7 247 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 DDIT4Q9NX09 232 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RABGGTBP53611 331 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 STAT4Q14765 748 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.315e-11■□□□□ 10.1
USP36-218ENST00000590546 TTC3P53804 2025 aa23.22■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 TRIM66O15016 1216 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 AMPD1P23109 780 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ATP5DP30049 168 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ZNF280DQ6N043 979 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 COX16Q9P0S2 106 aa23.21■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 RAD54BQ9Y620 910 aa23.21■■□□□ 1.31
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