RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 USP17L7P0C7H9 530 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PDGFRAP16234 1089 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GPD1P21695 349 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PSMA2P25787 234 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GBP1P32455 592 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NOS2P35228 1153 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MATKP42679 507 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PTPN9P43378 593 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NRIP1P48552 1158 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GPR15P49685 360 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DAAM2Q86T65 1068 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF276Q8N554 614 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GIPC2Q8TF65 315 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RNF139Q8WU17 664 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SERPINB11Q96P15 392 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MCEEQ96PE7 176 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ALG2Q9H553 416 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PLXNA3P51805 1871 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 E7ENQ6 273 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PIK3R2O00459 728 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PER2O15055 1255 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PSTPIP1O43586 416 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BUB1O43683 1085 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SPOPO43791 374 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TLR5O60602 858 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SOAT2O75908 522 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC2A3P11169 496 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NCAM1P13591 858 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EPCAMP16422 314 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PTPN2P17706 415 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PCK1P35558 622 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SOX11P35716 441 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CETN2P41208 172 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EPHA5P54756 1037 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 AIF1P55008 147 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ITIH3Q06033 890 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TAF10Q12962 218 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MESDQ14696 234 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 C2CD6Q53TS8 623 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DCAF6Q58WW2 860 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ODF2Q5BJF6 829 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HECTD3Q5T447 861 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LRRC38Q5VT99 294 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BSPRYQ5W0U4 402 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 Q6ZVU0 165 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 STRADAQ7RTN6 431 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PEX26Q7Z412 305 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms