RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf60A6NFR6 353 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL5CA6NH57 179 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 NRP1O14786 923 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF8O76064 485 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO7P57737 925 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 AUHQ13825 339 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 STAT4Q14765 748 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB6Q15916 424 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTA5Q7RTV2 222 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF12Q96FN5 646 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX27Q96L92 541 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TWNKQ96RR1 684 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 GAD1Q99259 594 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRD1A4D1F6 860 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 M0QYV0 167 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LILRB3O75022 631 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 EFEMP2O95967 443 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ERBB2P04626 1255 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 GJC1P36383 396 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G5P39877 138 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 BEST2Q8NFU1 509 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 EDAQ92838 391 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 STK39Q9UEW8 545 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LGALS13Q9UHV8 139 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH22Q9UJ99 828 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CITO14578 2027 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 DPYSL4O14531 572 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 MLH1P40692 756 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC25Q86WR0 208 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP42Q96MM3 310 aa26.49■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYLDQ9NQC7 956 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCH5Q9NX47 278 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 DNPEPQ9ULA0 475 aa26.49■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 ACTL7BQ9Y614 415 aa26.49■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.48■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 CA8P35219 290 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CHKAP35790 457 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SCNN1AP37088 669 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 NDST1P52848 882 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 JOSD2Q8TAC2 188 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 NINJ2Q9NZG7 142 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTN3Q9P232 1028 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT10P13645 584 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF4P15884 667 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 EPCAMP16422 314 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 DESP17661 470 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SCNN1GP51170 649 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC142Q17RM4 750 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF487B1APH4 448 aa26.46■■□□□ 1.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 ENDOD1O94919 500 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM163BP0C2L3 166 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 GPD1P21695 349 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 RASA2Q15283 850 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LLGL1Q15334 1064 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ALKAL1Q6UXT8 129 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TLDC2A0PJX2 215 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1CO00159 1063 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 NPTXRO95502 500 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 NR1H3Q13133 447 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CBLBQ13191 982 aa26.46■■□□□ 1.83
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