RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558673.1

KLF13-204, Transcript of Kruppel like factor 13, human

TSL 3

Gene KLF13, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLF13-204	ENST00000558673	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	COL15A1	P39059	1388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673		A0A087WZ62	844 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	WDR47	O94967	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TACR3	P29371	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	PBX1	P40424	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CPA2	P48052	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	INPPL1	O15357	1258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TOMM40	O96008	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ATIC	P31939	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	JAK3	P52333	1124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	MTX1	Q13505	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	STIM1	Q13586	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KLF13-204	ENST00000558673	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	PLAU	P00749	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	AR	P10275	920 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ME1	P48163	572 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ACOX1	Q15067	660 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	PHKB	Q93100	1093 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673		B4DGG1	531 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ATF3	P18847	181 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	IDUA	P35475	653 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	HSF1	Q00613	529 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	GAB1	Q13480	694 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	DAG1	Q14118	895 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLF13-204	ENST00000558673	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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