RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLIN2Q99541 437 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 BBS2Q9BXC9 721 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ASB7Q9H672 318 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CRTAC1Q9NQ79 661 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDRG1Q9NUG6 133 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLK2Q9NYY3 685 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 EHD2Q9NZN4 543 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.01□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRK1Q38SD2 2015 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A1B0GTQ1 180 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 H0YCG3 227 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 K7ENM7 598 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 GABRDO14764 452 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 WNT9AO14904 365 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 VILLO15195 856 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SUV39H1O43463 412 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 DFNA5O60443 496 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 GREM1O60565 184 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 JAK2O60674 1132 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP12O75317 370 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 KRT38O76015 456 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SEMA4FO95754 770 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 MT-CO3P00414 261 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PIGRP01833 764 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 WNT1P04628 370 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 IGHV4-34P06331 123 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ITGAVP06756 1048 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPHX1P07099 455 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDGFRBP09619 1106 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRKCHP24723 683 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 GUCY2CP25092 1073 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CD27P26842 260 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 YWHAQP27348 245 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PNPLA4P41247 253 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 LHX1P48742 406 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PGFP49763 221 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 BCAT1P54687 386 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 NCKAP1LP55160 1127 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDH8P55286 799 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 GABREP78334 506 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 GUCY1B3Q02153 619 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 BNIP3Q12983 259 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ORC1Q13415 861 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM29Q14134 588 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF234Q14588 700 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 IL17AQ16552 155 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 LINC00303Q3SY05 128 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARSHQ5FYA8 562 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 MDH1BQ5I0G3 518 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TTC38Q5R3I4 469 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 HECTD3Q5T447 861 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 KRT79Q5XKE5 535 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 VSTM1Q6UX27 236 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC81Q6ZN84 652 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATG14Q6ZNE5 492 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 HTR3DQ70Z44 454 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYCT1Q8N699 235 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 IGSF22Q8N9C0 903 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 C1orf127Q8N9H9 656 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 CXorf38Q8TB03 319 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SAP25Q8TEE9 199 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SORCS1Q8WY21 1168 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 FBXO32Q969P5 355 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 P2RY11Q96G91 374 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 PCED1BQ96HM7 432 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 C8orf48Q96LL4 319 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC6A18Q96N87 628 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYT15Q9BQS2 421 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 REEP2Q9BRK0 252 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM213AQ9BRX8 229 aa3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GTF3AP2-201ENST00000557014 TIPINQ9BVW5 301 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms