RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 TNIP3Q96KP6 325 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 BCAR3O75815 825 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 VIPP01282 170 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 GALNSP34059 522 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 SLC14A1Q13336 389 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 KCNJ12Q14500 433 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF778Q96MU6 729 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 RNF7Q9UBF6 113 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC82-208ENST00000545264 OR2W5A6NFC9 320 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PODXLO00592 558 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PLIN1O60240 522 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 JAK3P52333 1124 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 BFSP2Q13515 415 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MPEG1Q2M385 716 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SRLQ86TD4 932 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MAP4K1Q92918 833 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 GSTM5P46439 218 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 HSPA7P48741 367 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 GHRHRQ02643 423 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SEC23BQ15437 767 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MAP9Q49MG5 647 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 DEPTORQ8TB45 409 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA1191Q96A73 305 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SGCZQ96LD1 299 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 E5RJQ4 531 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 FCHO1O14526 889 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MMP8P22894 467 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 TACR3P29371 465 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MMP13P45452 471 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SEMA3BQ13214 749 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ETFDHQ16134 617 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 CNGA3Q16281 694 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 P3H1Q32P28 736 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ANO7Q6IWH7 933 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 TTC30AQ86WT1 665 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 FAM186BQ8IYM0 893 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 CUL5Q93034 780 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 NUAK2Q9H093 628 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 FNIP2Q9P278 1114 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 CA14Q9ULX7 337 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 VPS4AQ9UN37 437 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 MATN1P21941 496 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 DUSP1P28562 367 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC82-208ENST00000545264 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms