RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541175.1

PRR4-208, Transcript of proline rich 4, human

TSL 2

Gene PRR4, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-208	ENST00000541175	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	C4orf19	Q8IY42	314 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	LHX5	Q9H2C1	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175		A0A1W2PPC4	97 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	WASH3P	C4AMC7	463 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ACKR2	O00590	384 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TRIM38	O00635	465 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PLD2	O14939	933 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ANP32C	O43423	234 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MAGEC1	O60732	1142 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CNTN5	O94779	1100 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	NOL4	O94818	638 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	HDAC4	P56524	1084 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MYL7	Q01449	175 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	METTL23	Q86XA0	190 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	OR4C6	Q8NH72	309 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	NCOA7	Q8NI08	942 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PANK1	Q8TE04	598 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	LRRC15	Q8TF66	581 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	UCMA	Q8WVF2	138 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ARRDC3	Q96B67	414 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	HDAC11	Q96DB2	347 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	LXN	Q9BS40	222 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SGK2	Q9HBY8	427 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	BARHL2	Q9NY43	387 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CPQ	Q9Y646	472 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TRIP11	Q15643	1979 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TLR4	O00206	839 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MAN1A2	O60476	641 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SDC3	O75056	442 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CD99	P14209	185 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	PTGER4	P35408	488 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CDH8	P55286	799 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	NXPH1	P58417	271 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	OSTN	P61366	133 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SLC7A9	P82251	487 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CASC1	Q6TDU7	716 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	WDR48	Q8TAF3	677 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	IFI44	Q8TCB0	444 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	GJA10	Q969M2	543 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	MDFI	Q99750	246 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TCHP	Q9BT92	498 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	TRIM9	Q9C026	710 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	STRADB	Q9C0K7	418 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRR4-208	ENST00000541175	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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