RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522115.6

PTPN12-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 5

Gene PTPN12, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-215	ENST00000522115	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN12-215	ENST00000522115	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPN12-215	ENST00000522115	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN12-215	ENST00000522115	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN12-215	ENST00000522115	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN12-215	ENST00000522115	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115		E5RJQ4	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CA12	O43570	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	RNF8	O76064	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GLP2R	O95838	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	DUSP1	P28562	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	MPG	P29372	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	NEK3	P51956	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	2e-6	■■■□□ 16.2
PTPN12-215	ENST00000522115	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FCHO1	O14526	889 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FYB1	O15117	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PLIN1	O60240	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	MMP8	P22894	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GALNS	P34059	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	JAK3	P52333	1124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CFHR1	Q03591	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SEC23B	Q15437	767 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PODXL	O00592	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	DSCR3	O14972	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	NTSR2	O95665	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	THBS4	P35443	961 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	HSF1	Q00613	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	RAB30	Q15771	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SRL	Q86TD4	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	DRD1	P21728	446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	HTR3A	P46098	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF81	P51508	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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