RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TM2D2Q9BX73 214 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CHST8Q9H2A9 424 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 COL20A1Q9P218 1284 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 VPS51Q9UID3 782 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.74□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RRHO14718 337 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CA12O43570 354 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF1BP20333 461 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 MANEAQ5SRI9 462 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FAM57BQ71RH2 274 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FCRL5Q96RD9 977 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 LRRC27Q9C0I9 530 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 HMGXB3Q12766 1538 aa5.73□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD62A6NC57 917 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 GALNSP34059 522 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 COPAP53621 1224 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SLC12A2P55011 1212 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FMO1Q01740 532 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 KCNAB1Q14722 419 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A28Q96A46 364 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 VPS45Q9NRW7 570 aa5.72□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 PRXQ9BXM0 1461 aa5.71□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.71□□□□□ -1.49
SGCE-211ENST00000522045 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 DNASE1L3Q13609 305 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MANEALQ5VSG8 457 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PIGKQ92643 395 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 HPSEQ9Y251 543 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CUX2O14529 1486 aa5.71□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 COL15A1P39059 1388 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 LACTBL1A8MY62 500 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 F8W810 466 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RPS6KB1P23443 525 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 HTR7P34969 479 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 UNC13DQ70J99 1090 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 DECR2Q9NUI1 292 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PROCRQ9UNN8 238 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ARAP1Q96P48 1450 aa5.7□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 WDR47O94967 919 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 FGF2P09038 288 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CDC25AP30304 524 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RNF220Q5VTB9 566 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SESTD1Q86VW0 696 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 P2RY11Q96G91 374 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 APIPQ96GX9 242 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TGFB3P10600 412 aa5.68□□□□□ -1.5
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