RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLD2P49005 469 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS41P49754 854 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENTPD1P49961 510 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEK2P51955 445 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNGA3Q16281 694 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP49Q70CQ1 688 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIB2Q96AX9 1013 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AQP7P3A6NL99 342 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 H0YGN5 161 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV3-20P01619 116 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXB2P14652 356 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRAFP15056 766 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFEBP19484 476 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACVR2AP27037 513 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBL1P28749 1068 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLH1P40692 756 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPT1AP50416 773 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNAB1Q14722 419 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MICU3Q86XE3 530 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR4A3Q92570 626 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPAR1Q92633 364 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FZD3Q9NPG1 666 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS45Q9NRW7 570 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS4AQ9UN37 437 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP19O94966 1318 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAMTA2O94983 1202 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPNTQ6UXI9 565 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 YAF2Q8IY57 180 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 THSD1Q9NS62 852 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK32BQ9NY57 414 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MID2Q9UJV3 735 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFAP69A5D8W1 941 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPN8A6NHC0 703 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC34A8MYJ7 566 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 IDUAP35475 653 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAD2Q05329 585 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 LTBQ06643 244 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLGAP5Q15398 846 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MZT2AQ6P582 158 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 CUZD1Q86UP6 607 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SKAP1Q86WV1 359 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms