RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 WASF1Q92558 559 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PIGKQ92643 395 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 COL15A1P39059 1388 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RRHO14718 337 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TSPAN6O43657 245 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 HTR7P34969 479 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 DGKQP52824 942 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SLC12A2P55011 1212 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 CNGA3Q16281 694 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 GPR162Q16538 588 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MIDNQ504T8 468 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MARK4Q96L34 752 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FAM227BQ96M60 508 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 NLRP4Q96MN2 994 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FCRL5Q96RD9 977 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TM2D2Q9BX73 214 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 VPS4AQ9UN37 437 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 THAP12O43422 761 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TOMM40O96008 361 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 VPS41P49754 854 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 HTR6P50406 440 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MTA1Q13330 715 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 DNASE1L3Q13609 305 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 GBX1Q14549 363 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SEMA3AQ14563 771 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ACOX1Q15067 660 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FAM57BQ71RH2 274 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MMP21Q8N119 569 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 IQCDQ96DY2 449 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 WWOXQ9NZC7 414 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TTC34A8MYJ7 566 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RHCEP18577 417 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ATICP31939 592 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 THBS3P49746 956 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 B4GALNT1Q00973 533 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RHDQ02161 417 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 GPS1Q13098 491 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MTAPQ13126 283 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 UEVLDQ8IX04 471 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 LYZL4Q96KX0 146 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 F8W810 466 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 F8W8V4 182 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 ST6GAL1P15907 406 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 DRD1P21728 446 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RPS6KB1P23443 525 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 PBX1P40424 430 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 BFSP2Q13515 415 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 SEMA5AQ13591 1074 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 MANEAQ5SRI9 462 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-202ENST00000499038 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms