RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496596.1

RPL4P1-201, Transcript of ribosomal protein L4 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL4P1, Length 1,278 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P1-201ENST00000496596 ITGA8P53708 1063 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HDAC4P56524 1084 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DAOAP59103 153 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DEUP1Q05D60 604 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DSC1Q08554 894 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 GPS1Q13098 491 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DPYSL3Q14195 570 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NOMO1Q15155 1222 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TERF2Q15554 542 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 P3H1Q32P28 736 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 EFHC2Q5JST6 749 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RAB41Q5JT25 222 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 VSTM1Q6UX27 236 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 CENPUQ71F23 418 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 CCDC25Q86WR0 208 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RELL1Q8IUW5 271 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DEFB106AQ8N104 65 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NT5C3BQ969T7 300 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 MYLPFQ96A32 169 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 FAF2Q96CS3 445 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PPCSQ9HAB8 311 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RAD54BQ9Y620 910 aa8.66□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HACD1B0YJ81 288 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 H7C0C1 242 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 M0QYT0 321 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 CLDN5O00501 218 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NCAM2O15394 837 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HCRTO43612 131 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 IFNB1P01574 187 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 LTFP02788 710 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RBP3P10745 1247 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RFC2P35250 354 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 BRCC3P46736 316 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ATP5OP48047 213 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ADCY1Q08828 1119 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 MTA1Q13330 715 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 MBTPS1Q14703 1052 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TAF5Q15542 800 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 KRT71Q3SY84 523 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 CNPY4Q8N129 248 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HLA-CQ95604 372 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NTAN1Q96AB6 310 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PEBP4Q96S96 227 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 NPY6RQ99463 290 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SMOQ99835 787 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 COMMD8Q9NX08 183 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 PAK5Q9P286 719 aa8.65□□□□□ -1.02
RPL4P1-201ENST00000496596 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RPL4P1-201ENST00000496596 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RPL4P1-201ENST00000496596 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms