RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 FAM163BP0C2L3 166 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SEMA3BQ13214 749 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FHL2Q14192 279 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 NME8Q8N427 588 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TEX19Q8NA77 164 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.68□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 RARRES1P49788 294 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 DIO1P49895 249 aa5.68□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 DEUP1Q05D60 604 aa5.68□□□□□ -1.5
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CCL20-204ENST00000489160 DNASE1L3Q13609 305 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TAF5Q15542 800 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 BTBD16Q32M84 506 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ADCK5Q3MIX3 580 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FAM153CQ494X1 144 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PCID2Q5JVF3 399 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 DAPP1Q9UN19 280 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CA12O43570 354 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PPP6R2O75170 966 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LARGE1O95461 756 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ITPKBP27987 946 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CXCR5P32302 372 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MAN1A1P33908 653 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ADD2P35612 726 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G5P39877 138 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 INHBCP55103 352 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PSG6Q00889 435 aa5.67□□□□□ -1.5
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